El programa tiene una duración de 15 meses, organizado en 4 trimestres de 15 semanas cada uno, con un total de 52 créditos académicos. Durante los primeros tres trimestres, se combinan clases teóricas con actividades prácticas, integrando un enfoque aplicado y estratégico. El cuarto trimestre está dedicado a la elaboración de una tesis de investigación dentro el campus de Zamorano.

Durante el primer trimestre, el enfoque se centra en las teorías de la sostenibilidad, proporcionando un fundamento conceptual para el análisis de la agricultura desde una perspectiva sistémica. Los/as alumnos/as investigan la aplicación de los principios de sostenibilidad en el sector agropecuario, comprendiendo las interrelaciones entre los elementos agronómicos y ecológicos. Esta fase incorpora conceptos como la agroecología, la agricultura regenerativa, el ciclo de vida y la economía circular, entre otros.

El segundo trimestre pone énfasis en la gestión de recursos críticos, tales como suelos, nutrientes y agua. En esta etapa se adquieren habilidades para elaborar estrategias destinadas a reemplazar prácticas menos eficaces por innovaciones tales como la agricultura de precisión.

En el tercer trimestre, se enfoca en el rediseño de agroecosistemas, una fase crítica para la consecución de la sostenibilidad a gran escala. Los/as estudiantes implementan las competencias adquiridas en la concepción de sistemas agrícolas innovadores, aprovechando procesos ecológicos como la fijación de nitrógeno, la polinización y la gestión de plagas.

 
En el cuarto trimestre, los/as estudiantes consolidan sus conocimientos mediante la elaboración de una tesis de investigación centrada en problemas agrícolas concretos. Este proyecto puede englobar desde el examen de la sostenibilidad hasta la concepción de sistemas innovadores o la puesta en marcha de tecnologías emergentes. La tesis no solo facilita la implementación práctica de los conocimientos, sino que además capacita a la comunidad estudiantil para dirigir transformaciones significativas en el ámbito de la agricultura global.